Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
H3f3aP84244 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H3f3aP84244 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H3f3aP84244 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3f3aP84244 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3f3aP84244 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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