Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf1P84078 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf1P84078 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arf1P84078 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf1P84078 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf1P84078 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf1P84078 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf1P84078 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf1P84078 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf1P84078 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf1P84078 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf1P84078 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf1P84078 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf1P84078 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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