Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx1P83917 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx1P83917 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx1P83917 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx1P83917 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx1P83917 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms