Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb6P70689 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb6P70689 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjb6P70689 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb6P70689 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb6P70689 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms