Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgf11P70378 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgf11P70378 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgf11P70378 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf11P70378 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgf11P70378 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgf11P70378 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms