Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gfi1P70338 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfi1P70338 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfi1P70338 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfi1P70338 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms