Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbx6P70327 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbx6P70327 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx6P70327 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbx6P70327 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx6P70327 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms