Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac2P70288 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac2P70288 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac2P70288 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac2P70288 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms