Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fv1P70213 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fv1P70213 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv1P70213 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv1P70213 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv1P70213 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fv1P70213 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv1P70213 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv1P70213 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fv1P70213 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv1P70213 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fv1P70213 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fv1P70213 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fv1P70213 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fv1P70213 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fv1P70213 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv1P70213 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv1P70213 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv1P70213 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv1P70213 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv1P70213 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fv1P70213 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fv1P70213 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fv1P70213 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fv1P70213 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fv1P70213 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fv1P70213 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fv1P70213 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv1P70213 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms