Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrig1P70193 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig1P70193 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrig1P70193 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms