Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl18aP62717 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl18aP62717 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl18aP62717 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl18aP62717 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms