Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpd1P62315 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpd1P62315 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpd1P62315 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snrpd1P62315 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms