Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd6P61407 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd6P61407 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tdrd6P61407 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms