Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ActbP60710 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ActbP60710 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ActbP60710 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ActbP60710 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ActbP60710 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ActbP60710 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ActbP60710 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ActbP60710 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ActbP60710 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ActbP60710 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ActbP60710 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ActbP60710 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ActbP60710 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ActbP60710 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ActbP60710 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ActbP60710 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ActbP60710 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ActbP60710 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ActbP60710 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ActbP60710 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ActbP60710 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ActbP60710 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ActbP60710 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ActbP60710 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ActbP60710 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ActbP60710 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ActbP60710 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ActbP60710 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ActbP60710 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ActbP60710 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ActbP60710 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ActbP60710 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ActbP60710 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ActbP60710 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ActbP60710 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ActbP60710 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ActbP60710 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ActbP60710 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ActbP60710 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ActbP60710 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ActbP60710 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ActbP60710 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ActbP60710 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ActbP60710 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ActbP60710 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ActbP60710 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ActbP60710 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ActbP60710 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ActbP60710 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ActbP60710 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ActbP60710 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ActbP60710 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ActbP60710 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ActbP60710 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ActbP60710 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ActbP60710 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ActbP60710 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ActbP60710 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ActbP60710 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ActbP60710 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ActbP60710 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ActbP60710 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ActbP60710 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ActbP60710 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ActbP60710 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ActbP60710 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ActbP60710 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ActbP60710 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ActbP60710 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ActbP60710 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ActbP60710 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ActbP60710 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ActbP60710 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ActbP60710 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ActbP60710 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ActbP60710 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ActbP60710 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ActbP60710 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ActbP60710 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms