Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rin3P59729 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin3P59729 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rin3P59729 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin3P59729 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin3P59729 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rin3P59729 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin3P59729 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rin3P59729 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin3P59729 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin3P59729 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin3P59729 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin3P59729 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms