Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b6P59708 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b6P59708 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b6P59708 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms