Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hps5P59438 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps5P59438 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps5P59438 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hps5P59438 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps5P59438 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps5P59438 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps5P59438 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hps5P59438 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps5P59438 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps5P59438 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps5P59438 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps5P59438 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps5P59438 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms