Protein–RNA interactions for Protein: P59281

Arhgap39, Rho GTPase-activating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap39P59281 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap39P59281 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap39P59281 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arhgap39P59281 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap39P59281 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap39P59281 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms