Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Scarf2P59222 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Scarf2P59222 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Scarf2P59222 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Scarf2P59222 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Scarf2P59222 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Scarf2P59222 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms