Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpaP58389 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpaP58389 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpaP58389 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpaP58389 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpaP58389 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpaP58389 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpaP58389 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpaP58389 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpaP58389 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpaP58389 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpaP58389 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpaP58389 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms