Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lim2P56563 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lim2P56563 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lim2P56563 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lim2P56563 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lim2P56563 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lim2P56563 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lim2P56563 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lim2P56563 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lim2P56563 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lim2P56563 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lim2P56563 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lim2P56563 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lim2P56563 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lim2P56563 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lim2P56563 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lim2P56563 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lim2P56563 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lim2P56563 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms