Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nub1P54729 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nub1P54729 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nub1P54729 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nub1P54729 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nub1P54729 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nub1P54729 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nub1P54729 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nub1P54729 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nub1P54729 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nub1P54729 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nub1P54729 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nub1P54729 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nub1P54729 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nub1P54729 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nub1P54729 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nub1P54729 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nub1P54729 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms