Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab2aP53994 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab2aP53994 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab2aP53994 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab2aP53994 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms