Protein–RNA interactions for Protein: P53668

Limk1, LIM domain kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk1P53668 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Limk1P53668 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Limk1P53668 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Limk1P53668 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limk1P53668 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limk1P53668 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limk1P53668 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limk1P53668 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limk1P53668 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limk1P53668 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Limk1P53668 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limk1P53668 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Limk1P53668 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms