Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CebpaP53566 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CebpaP53566 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CebpaP53566 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CebpaP53566 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CebpaP53566 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CebpaP53566 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CebpaP53566 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CebpaP53566 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CebpaP53566 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CebpaP53566 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CebpaP53566 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CebpaP53566 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CebpaP53566 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CebpaP53566 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CebpaP53566 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CebpaP53566 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CebpaP53566 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CebpaP53566 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CebpaP53566 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CebpaP53566 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CebpaP53566 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CebpaP53566 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CebpaP53566 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms