Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epb41l4aP52963 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epb41l4aP52963 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epb41l4aP52963 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb41l4aP52963 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epb41l4aP52963 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms