Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt2P50752 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt2P50752 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt2P50752 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt2P50752 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt2P50752 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt2P50752 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms