Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanccP50652 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanccP50652 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanccP50652 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanccP50652 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanccP50652 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanccP50652 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanccP50652 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanccP50652 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanccP50652 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanccP50652 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FanccP50652 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FanccP50652 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanccP50652 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanccP50652 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanccP50652 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanccP50652 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanccP50652 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanccP50652 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanccP50652 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanccP50652 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanccP50652 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FanccP50652 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanccP50652 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanccP50652 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanccP50652 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanccP50652 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanccP50652 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanccP50652 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanccP50652 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanccP50652 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanccP50652 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanccP50652 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanccP50652 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanccP50652 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanccP50652 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanccP50652 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanccP50652 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanccP50652 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanccP50652 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FanccP50652 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanccP50652 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanccP50652 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanccP50652 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanccP50652 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanccP50652 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FanccP50652 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FanccP50652 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FanccP50652 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FanccP50652 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FanccP50652 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FanccP50652 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FanccP50652 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FanccP50652 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FanccP50652 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FanccP50652 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FanccP50652 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FanccP50652 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FanccP50652 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FanccP50652 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FanccP50652 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FanccP50652 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FanccP50652 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FanccP50652 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FanccP50652 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FanccP50652 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FanccP50652 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FanccP50652 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FanccP50652 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FanccP50652 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FanccP50652 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FanccP50652 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FanccP50652 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FanccP50652 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FanccP50652 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FanccP50652 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FanccP50652 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FanccP50652 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FanccP50652 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FanccP50652 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FanccP50652 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FanccP50652 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FanccP50652 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FanccP50652 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FanccP50652 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FanccP50652 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FanccP50652 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FanccP50652 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms