Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl5P50228 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl5P50228 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcl5P50228 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms