Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc13P50207 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc13P50207 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc13P50207 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxc13P50207 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc13P50207 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc13P50207 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms