Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cav1P49817 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cav1P49817 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cav1P49817 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cav1P49817 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cav1P49817 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cav1P49817 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cav1P49817 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cav1P49817 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cav1P49817 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cav1P49817 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cav1P49817 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cav1P49817 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cav1P49817 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cav1P49817 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cav1P49817 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms