Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptx3P48759 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptx3P48759 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptx3P48759 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx3P48759 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptx3P48759 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptx3P48759 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptx3P48759 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptx3P48759 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ptx3P48759 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptx3P48759 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptx3P48759 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms