Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx2P48379 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx2P48379 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx2P48379 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx2P48379 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms