Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfrsf4P47741 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf4P47741 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf4P47741 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf4P47741 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms