Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syt1P46096 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syt1P46096 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Syt1P46096 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Syt1P46096 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt1P46096 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt1P46096 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syt1P46096 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syt1P46096 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syt1P46096 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syt1P46096 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syt1P46096 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syt1P46096 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syt1P46096 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syt1P46096 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syt1P46096 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt1P46096 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syt1P46096 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syt1P46096 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms