Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf9P41274 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsf9P41274 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf9P41274 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf9P41274 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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