Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighmbp2P40694 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighmbp2P40694 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighmbp2P40694 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ighmbp2P40694 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ighmbp2P40694 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms