Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fen1P39749 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fen1P39749 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fen1P39749 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fen1P39749 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fen1P39749 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fen1P39749 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fen1P39749 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fen1P39749 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fen1P39749 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fen1P39749 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fen1P39749 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fen1P39749 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fen1P39749 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fen1P39749 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fen1P39749 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fen1P39749 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fen1P39749 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fen1P39749 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms