Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PpargP37238 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpargP37238 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpargP37238 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpargP37238 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpargP37238 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpargP37238 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpargP37238 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpargP37238 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpargP37238 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpargP37238 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpargP37238 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpargP37238 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpargP37238 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpargP37238 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpargP37238 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpargP37238 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpargP37238 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpargP37238 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpargP37238 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpargP37238 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpargP37238 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpargP37238 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpargP37238 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpargP37238 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpargP37238 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpargP37238 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpargP37238 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpargP37238 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpargP37238 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpargP37238 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PpargP37238 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpargP37238 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpargP37238 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpargP37238 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PpargP37238 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpargP37238 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpargP37238 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpargP37238 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpargP37238 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpargP37238 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpargP37238 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpargP37238 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PpargP37238 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PpargP37238 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpargP37238 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpargP37238 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpargP37238 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpargP37238 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpargP37238 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpargP37238 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpargP37238 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PpargP37238 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PpargP37238 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PpargP37238 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PpargP37238 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PpargP37238 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpargP37238 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpargP37238 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpargP37238 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpargP37238 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpargP37238 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpargP37238 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpargP37238 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpargP37238 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpargP37238 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PpargP37238 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpargP37238 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpargP37238 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpargP37238 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpargP37238 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpargP37238 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpargP37238 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpargP37238 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpargP37238 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpargP37238 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpargP37238 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpargP37238 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpargP37238 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpargP37238 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpargP37238 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms