Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdlrP35951 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdlrP35951 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdlrP35951 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdlrP35951 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdlrP35951 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdlrP35951 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdlrP35951 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdlrP35951 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LdlrP35951 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LdlrP35951 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdlrP35951 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LdlrP35951 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LdlrP35951 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdlrP35951 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdlrP35951 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LdlrP35951 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdlrP35951 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdlrP35951 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms