Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Folr1P35846 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Folr1P35846 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Folr1P35846 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Folr1P35846 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Folr1P35846 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Folr1P35846 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Folr1P35846 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Folr1P35846 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Folr1P35846 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Folr1P35846 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Folr1P35846 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Folr1P35846 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Folr1P35846 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Folr1P35846 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Folr1P35846 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Folr1P35846 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Folr1P35846 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Folr1P35846 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Folr1P35846 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Folr1P35846 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Folr1P35846 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms