Protein–RNA interactions for Protein: P35700

Prdx1, Peroxiredoxin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx1P35700 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdx1P35700 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdx1P35700 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdx1P35700 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdx1P35700 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdx1P35700 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms