Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd22P35329 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cd22P35329 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cd22P35329 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cd22P35329 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd22P35329 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd22P35329 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cd22P35329 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cd22P35329 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cd22P35329 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cd22P35329 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd22P35329 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd22P35329 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd22P35329 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd22P35329 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cd22P35329 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cd22P35329 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms