Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd1P33215 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd1P33215 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nedd1P33215 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nedd1P33215 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd1P33215 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms