Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Saa4P31532 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Saa4P31532 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Saa4P31532 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Saa4P31532 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Saa4P31532 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Saa4P31532 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Saa4P31532 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Saa4P31532 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Saa4P31532 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Saa4P31532 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Saa4P31532 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Saa4P31532 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Saa4P31532 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Saa4P31532 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Saa4P31532 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Saa4P31532 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Saa4P31532 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms