Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxrgP28705 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RxrgP28705 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RxrgP28705 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RxrgP28705 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrgP28705 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrgP28705 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrgP28705 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrgP28705 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RxrgP28705 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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