Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RxraP28700 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RxraP28700 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RxraP28700 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RxraP28700 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RxraP28700 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RxraP28700 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RxraP28700 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RxraP28700 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RxraP28700 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RxraP28700 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxraP28700 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxraP28700 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxraP28700 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxraP28700 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RxraP28700 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxraP28700 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxraP28700 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RxraP28700 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RxraP28700 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RxraP28700 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RxraP28700 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxraP28700 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RxraP28700 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RxraP28700 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RxraP28700 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RxraP28700 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RxraP28700 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RxraP28700 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RxraP28700 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxraP28700 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxraP28700 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxraP28700 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxraP28700 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxraP28700 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxraP28700 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxraP28700 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxraP28700 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxraP28700 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxraP28700 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxraP28700 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxraP28700 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxraP28700 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxraP28700 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxraP28700 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxraP28700 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RxraP28700 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxraP28700 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxraP28700 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxraP28700 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RxraP28700 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxraP28700 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxraP28700 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RxraP28700 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxraP28700 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxraP28700 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxraP28700 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxraP28700 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxraP28700 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxraP28700 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxraP28700 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxraP28700 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxraP28700 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxraP28700 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxraP28700 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxraP28700 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxraP28700 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxraP28700 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxraP28700 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxraP28700 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxraP28700 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxraP28700 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxraP28700 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxraP28700 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RxraP28700 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxraP28700 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RxraP28700 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RxraP28700 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RxraP28700 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RxraP28700 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxraP28700 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms