Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd9P28357 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd9P28357 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd9P28357 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd9P28357 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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