Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apex1P28352 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apex1P28352 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apex1P28352 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apex1P28352 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apex1P28352 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apex1P28352 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apex1P28352 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apex1P28352 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex1P28352 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex1P28352 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apex1P28352 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms