Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2afxP27661 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H2afxP27661 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2afxP27661 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2afxP27661 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2afxP27661 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afxP27661 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2afxP27661 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afxP27661 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2afxP27661 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afxP27661 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afxP27661 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2afxP27661 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2afxP27661 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms